Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCINQ13939 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCINQ13939 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCINQ13939 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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