Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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