Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
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CUL3Q13618 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CUL3Q13618 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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CUL3Q13618 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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CUL3Q13618 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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CUL3Q13618 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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