Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
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