Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATMQ13315 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMQ13315 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATMQ13315 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATMQ13315 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATMQ13315 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATMQ13315 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ATMQ13315 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATMQ13315 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATMQ13315 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ATMQ13315 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATMQ13315 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATMQ13315 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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