Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms