Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENBP1Q13228 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms