Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN3Q13064 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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