Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TROQ12816 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TROQ12816 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TROQ12816 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TROQ12816 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TROQ12816 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TROQ12816 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TROQ12816 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TROQ12816 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TROQ12816 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TROQ12816 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TROQ12816 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TROQ12816 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TROQ12816 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TROQ12816 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TROQ12816 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TROQ12816 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TROQ12816 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TROQ12816 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TROQ12816 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TROQ12816 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TROQ12816 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TROQ12816 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TROQ12816 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TROQ12816 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TROQ12816 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TROQ12816 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TROQ12816 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TROQ12816 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TROQ12816 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TROQ12816 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TROQ12816 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TROQ12816 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TROQ12816 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TROQ12816 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TROQ12816 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TROQ12816 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TROQ12816 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TROQ12816 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TROQ12816 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TROQ12816 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TROQ12816 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TROQ12816 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TROQ12816 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TROQ12816 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TROQ12816 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TROQ12816 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TROQ12816 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TROQ12816 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TROQ12816 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TROQ12816 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TROQ12816 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TROQ12816 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TROQ12816 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TROQ12816 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TROQ12816 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TROQ12816 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TROQ12816 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TROQ12816 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TROQ12816 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TROQ12816 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TROQ12816 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TROQ12816 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TROQ12816 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TROQ12816 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
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