Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms