Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms