Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CD164Q04900 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CD164Q04900 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CD164Q04900 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CD164Q04900 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CD164Q04900 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CD164Q04900 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CD164Q04900 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CD164Q04900 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CD164Q04900 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CD164Q04900 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CD164Q04900 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CD164Q04900 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CD164Q04900 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CD164Q04900 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CD164Q04900 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CD164Q04900 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms