Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms