Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP27A1Q02318 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms