Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms