Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
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