Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms