Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD247P20963 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD247P20963 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD247P20963 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD247P20963 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD247P20963 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms