Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUC1P15941 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUC1P15941 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUC1P15941 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MUC1P15941 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUC1P15941 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUC1P15941 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUC1P15941 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUC1P15941 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUC1P15941 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUC1P15941 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUC1P15941 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC1P15941 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC1P15941 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms