Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPLO60437 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPLO60437 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPLO60437 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPLO60437 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPLO60437 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PPLO60437 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PPLO60437 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPLO60437 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PPLO60437 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPLO60437 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPLO60437 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPLO60437 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPLO60437 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPLO60437 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPLO60437 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPLO60437 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPLO60437 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPLO60437 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PPLO60437 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPLO60437 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPLO60437 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPLO60437 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPLO60437 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPLO60437 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPLO60437 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PPLO60437 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPLO60437 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPLO60437 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPLO60437 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPLO60437 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPLO60437 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPLO60437 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPLO60437 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPLO60437 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PPLO60437 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPLO60437 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPLO60437 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPLO60437 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPLO60437 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms