Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRXO43186 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRXO43186 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRXO43186 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRXO43186 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRXO43186 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRXO43186 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRXO43186 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRXO43186 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRXO43186 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRXO43186 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRXO43186 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRXO43186 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRXO43186 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRXO43186 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRXO43186 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRXO43186 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRXO43186 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRXO43186 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRXO43186 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRXO43186 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRXO43186 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms