Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCAO15360 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCAO15360 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCAO15360 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCAO15360 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCAO15360 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCAO15360 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCAO15360 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCAO15360 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCAO15360 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCAO15360 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCAO15360 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCAO15360 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCAO15360 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCAO15360 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCAO15360 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCAO15360 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCAO15360 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCAO15360 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCAO15360 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FANCAO15360 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FANCAO15360 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FANCAO15360 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FANCAO15360 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FANCAO15360 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FANCAO15360 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FANCAO15360 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FANCAO15360 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FANCAO15360 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FANCAO15360 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FANCAO15360 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FANCAO15360 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FANCAO15360 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FANCAO15360 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FANCAO15360 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FANCAO15360 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FANCAO15360 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FANCAO15360 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FANCAO15360 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FANCAO15360 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FANCAO15360 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FANCAO15360 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FANCAO15360 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FANCAO15360 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FANCAO15360 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FANCAO15360 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FANCAO15360 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FANCAO15360 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FANCAO15360 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FANCAO15360 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FANCAO15360 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FANCAO15360 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FANCAO15360 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCAO15360 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCAO15360 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCAO15360 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCAO15360 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCAO15360 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCAO15360 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCAO15360 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCAO15360 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCAO15360 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCAO15360 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCAO15360 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCAO15360 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCAO15360 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCAO15360 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCAO15360 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCAO15360 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCAO15360 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCAO15360 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCAO15360 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FANCAO15360 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCAO15360 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FANCAO15360 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FANCAO15360 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms