Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00312Q9Y6C7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms