Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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