Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms