Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms