Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms