Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSU72Q9NP77 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSU72Q9NP77 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSU72Q9NP77 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms