Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms