Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms