Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms