Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms