Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SELENOMQ8WWX9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SELENOMQ8WWX9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms