Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW36

ZCCHC13, Zinc finger CCHC domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC13Q8WW36 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZCCHC13Q8WW36 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZCCHC13Q8WW36 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZCCHC13Q8WW36 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZCCHC13Q8WW36 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZCCHC13Q8WW36 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZCCHC13Q8WW36 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZCCHC13Q8WW36 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZCCHC13Q8WW36 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms