Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms