Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms