Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms