Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms