Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms