Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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