Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms