Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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SGCAQ16586 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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SGCAQ16586 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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SGCAQ16586 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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SGCAQ16586 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms