Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms