Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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