Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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NR6A1Q15406 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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NR6A1Q15406 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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NR6A1Q15406 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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NR6A1Q15406 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR6A1Q15406 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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