Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTTNQ14247 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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