Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms