Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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