Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms