Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms